Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms