Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP4Q9UKK3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms