Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms