Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPA4Q9UI42 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms