Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms