Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLKQ9UBE8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms