Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms