Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXXC1Q9P0U4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXXC1Q9P0U4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms