Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms