Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCMF1Q9P0J7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms