Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53CQ9NYF3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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