Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT57Q9NWB7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms