Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT13Q9NUP7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms