Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMSN1Q9NSI8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMSN1Q9NSI8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms