Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL17Q9NRX2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms