Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms