Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPIFA1Q9NP55 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms