Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRA1Q9HD15 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRA1Q9HD15 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRA1Q9HD15 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRA1Q9HD15 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRA1Q9HD15 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRA1Q9HD15 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRA1Q9HD15 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms