Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPF2Q9HAU5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms