Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RWDD1Q9H446 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD1Q9H446 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms