Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP62CLQ9H1M0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms