Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDCBP2Q9H190 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms