Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2J2Q9GZM3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 339 ms