Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2OQ9C0C9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms