Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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