Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DSCC1Q9BVC3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSCC1Q9BVC3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms