Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIOK1Q9BRS2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms