Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM7Q9BQ49 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms