Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms