Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF13CQ96RJ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms