Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms