Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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