Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMTK3Q96Q04 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms