Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms