Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SENP8Q96LD8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms