Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS50Q96JG6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS50Q96JG6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms