Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLG2Q96I99 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLG2Q96I99 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms