Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms