Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGF29Q96ES7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGF29Q96ES7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms