Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms