Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms