Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms