Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTI1AQ96AJ9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms