Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKL1Q969V6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKL1Q969V6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms