Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF34Q969K3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms