Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCE1Q969G3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms