Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms