Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms