Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRSK1Q8TDC3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRSK1Q8TDC3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRSK1Q8TDC3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRSK1Q8TDC3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms