Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL11Q8NHH1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms